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Metagenómica Shotgun
Servicio Estrella – Tecnología NGS

Análisis Metagenómico Shotgun
Visualizador Taxonómico Interactivo

Explora la diversidad microbiológica completa de tu muestra. Haz clic en cualquier sector del gráfico para profundizar en la jerarquía taxonómica. Navega desde el dominio hasta la especie.

Bacteria
Fungi
Virus
Archaea
Nematodos
NGS · Illumina

¿Cómo funciona la Metagenómica Shotgun?

Del campo al perfil taxonómico completo en 5 pasos

1. Muestra

Suelo, alimento, bioinsumo, agua, tejido o miel

2. Extracción ADN total

De todos los microorganismos presentes

3. Secuenciación NGS

Millones de lecturas con Illumina de última generación

4. Análisis Bioinformático

Asignación taxonómica precisa hasta nivel especie

5. Perfil Krona

Visualización interactiva de toda la comunidad microbiana

Profundidad:
Fuente:
Toda la muestra
IDgen
Innovación en Genómica
Dominios:
Bacteria
Fungi
Virus
Archaea
Nematoda
Protozoa
Otros
Haz clic en cualquier sector para navegar
2.4M
Lecturas totales
312
Taxones identificados
7
Niveles taxonómicos
94.7%
Lecturas clasificadas

¿Para qué sirve este análisis en el sector agroindustrial?

  • Bioinsumos: Verifica la identidad y pureza de inoculantes microbianos. Detecta contaminantes potencialmente patógenos.
  • Suelos agrícolas: Caracteriza la microbiota del suelo, evalúa la salud microbiana y el impacto de prácticas de manejo.
  • Alimentos y productos apícolas: Perfil microbiológico completo de mieles, pan de abeja, alimentos fermentados y productos procesados.
  • Agua de riego: Detecta patógenos de plantas y humanos (Ralstonia, Phytophthora, Salmonella) antes de que afecten el cultivo.
  • Investigación agropecuaria: Estudios de microbioma rizosférico, endofitos, microbiotas de postcosecha e interacciones planta-microorganismo.
  • Control de calidad agroindustrial: Monitoreo microbiológico de líneas de producción, superficies y ambientes de planta.

¿Por qué elegir IDGEN para tu metagenómica?

La metagenómica shotgun es la tecnología de diagnóstico microbiológico más completa disponible. A diferencia de los métodos de cultivo o PCR específico, no requiere saber qué estás buscando: revela todo el universo microbiano de tu muestra en un solo análisis.

En IDGEN combinamos la mejor plataforma NGS con un pipeline bioinformático optimizado para muestras agroalimentarias, y entregamos resultados con el visualizador Krona interactivo más el reporte técnico interpretado para tu sector.

Sequencing depth: ≥ 10M reads por muestra
Bases de datos: RefSeq, NCBI NT, SILVA, UNITE
Entrega: reporte PDF + archivo Krona interactivo
Acompañamiento en interpretación de resultados

¿Tienes muestras listas para analizar?

Escríbenos con el tipo de muestra y el objetivo del análisis. Te enviamos el protocolo de colecta y el presupuesto en menos de 24h.

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